اثر ضد ویروسی ویتامین B12 علیه ویروس SARS-COVID-19 الهام گرفته از کوانتوم
کشف اثر ضد ویروسی ویتامین B12 علیه SARS-COVID-19 با روشی الهام گرفته از کوانتوم موضوع مهمی است که بسیار روی آن تحقیق شده است.
در حال حاضر داروی Remdesivir (RDV) تنها ضد ویروس علیه SARS-CoV-2 است که برای استفاده انسانی تأیید شده میباشد.
در این مطالعه از دو روش علیه ویروس SARS-CoV-2 برای جستجوی ترکیباتی مشابه رمدسیور استفاده شده:
1) مدل (QUBO) مدل بهینه سازی بی حد و مرز که الهام گرفته از کوانتوم است.
2) مدل Tanimoto یا همان اثر انگشت که روشی سنتی است.
9با استفاده از یک دستگاه الهام گرفته از کوانتوم ، از یک مدل بهینه سازی دودویی بی حد و مرز درجه دو (QUBO) استفاده کردیم.
ارزیابی تصادفی آزمایش COVID-19 (RECOVERY) نمونه ای از تغییر مکان دارو در طول SARS-COVID-19 است، در واقع یک آزمایش چند مرکزه که امکان بررسی اثربخشی داروهای تایید شده برای درمان COVID-19 را فراهم می کند.
در این آزمایش نشان داده شده است که توسیلیزوماب و دگزامتازون باعث بهبود بقا در بیماران بستری در بیمارستان می شوند و اکنون در کلینیک مورد استفاده قرار می گیرند.
Remdesivir (RDV) که در ابتدا علیه ویروس ابولا طراحی شده است و نیز برای استفاده در بیماران COVID-19 تأیید شده است، البته داده های اخیر متناقض است.
عملکرد رمدیسیور به ویژگی های آن به عنوان یک آنالوگ نوکلئوزیدی متکی است و توسط آن به پلیمراز وابسته به RNA (RdRP) SARS متصل می شود، و مانع از کشیدگی زنجیره می شود. مولنوپیراویر آنالوگ نوکلئوزیدی دیگری است که به عنوان یک ضد ویروس بالقوه علیه SARS-CoV-2.3 در حال ظهور است اگرچه این ترکیبات اثرات خاصی بر روی پلیمرازهای ویروسی دارند اما عوارض جانبی متعددی در ارتباط با آنها گزارش شده : مانند حالت تهوع یا اختلالات کبدی. علاوه بر این، هزینه بر هستند و اجرای آنها نیاز به تلاش های اقتصادی دارد که در بسیاری از کشورها قابل انجام نیست.
بنابراین یک نیاز فوری برای شناسایی ترکیبات ضد ویروسی جدید وجود دارد که دارای عوارض جانبی کم و بدون اثر بوده و به راحتی و از نظر اقتصادی در دسترس باشند.
در این مطالعه بر اساس موفقیت اولیه RDV ، بازدارنده های جدید SARS-CoV-2 را بررسی شده است.
استفاده از یک مدل بهینه سازی (QUBO) که با دستگاه الهام گرفته از کوانتوم اجرا می شود، و همچنین یک روش اثر انگشت سنتی ترTanimoto غربال سازی انجام شده است.
هر دو الگوریتم چندین نامزد با شباهت زیاد به RDV را پیش بینی کرده اند، GS-6620 توسط هر دو پیش بینی شده است.
(QUBO) پیش بینی BMS-986094 را به عنوان دومین و Tanimoto به چندین شکل کوبامامید، که به عنوان ویتامین B12 شناخته می شود، کرده است.
سپس از روش های سلولی کشت داده شده برای تعیین توانایی بازدارندگی SARS-CoV-2 این ترکیبات استفاده شد. BMS-986094 ، هیدروکسوکوبالامین ، متیل کوبالامین و کوبامامید همه ثابت شدند ، با غلظت مهارکننده باعث کاهش عفونت به نصف (IC50) در محدوده های مناسب برای استفاده انسان می شوند.
طبق این مطالعه نشان داده شده است که این ترکیبات در برابر تعدادی از انواع SARS-CoV-2 ، از جمله موارد شناخته شده به عنوان آلفا ، بتا و دلتا (به ترتیب B.1.1.7 ، B.1.351 و B.1.617.2) در دو مدل های سلولی داده های ما قدرت استفاده از محاسبات الهام گرفته از کوانتوم برای استفاده مجدد دارو و همچنین نقش جدید بالقوه ویتامین B12 در درمان عفونت های SARS-CoV-2 را نشان می دهد.
REFERENCES:
doi: https://doi.org/10.1101/2021.06.25.449609
Dr. Fatemeh Ashkan